Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
SHPRHQ149N8 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SHPRHQ149N8 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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