Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
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