Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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ATMQ13315 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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ATMQ13315 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATMQ13315 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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ATMQ13315 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ATMQ13315 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATMQ13315 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATMQ13315 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATMQ13315 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATMQ13315 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ATMQ13315 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATMQ13315 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ATMQ13315 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ATMQ13315 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ATMQ13315 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ATMQ13315 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATMQ13315 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATMQ13315 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATMQ13315 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ATMQ13315 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATMQ13315 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ATMQ13315 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ATMQ13315 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATMQ13315 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATMQ13315 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATMQ13315 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATMQ13315 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATMQ13315 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ATMQ13315 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ATMQ13315 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ATMQ13315 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
ATMQ13315 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ATMQ13315 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ATMQ13315 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATMQ13315 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATMQ13315 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
ATMQ13315 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
ATMQ13315 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
ATMQ13315 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
ATMQ13315 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
ATMQ13315 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
ATMQ13315 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.08
ATMQ13315 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
ATMQ13315 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
ATMQ13315 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
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