Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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GRIN2BQ13224 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIN2BQ13224 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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