Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PITX3O75364 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PITX3O75364 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PITX3O75364 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PITX3O75364 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PITX3O75364 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PITX3O75364 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PITX3O75364 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PITX3O75364 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PITX3O75364 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PITX3O75364 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PITX3O75364 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PITX3O75364 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PITX3O75364 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PITX3O75364 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PITX3O75364 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PITX3O75364 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PITX3O75364 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PITX3O75364 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PITX3O75364 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PITX3O75364 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PITX3O75364 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PITX3O75364 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PITX3O75364 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PITX3O75364 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PITX3O75364 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PITX3O75364 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PITX3O75364 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PITX3O75364 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PITX3O75364 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PITX3O75364 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PITX3O75364 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PITX3O75364 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PITX3O75364 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PITX3O75364 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PITX3O75364 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PITX3O75364 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms