Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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USP35Q9P2H5 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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USP35Q9P2H5 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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USP35Q9P2H5 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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USP35Q9P2H5 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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USP35Q9P2H5 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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