Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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