Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms