Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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