Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A2Q14055 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A2Q14055 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A2Q14055 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A2Q14055 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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COL9A2Q14055 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A2Q14055 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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COL9A2Q14055 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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COL9A2Q14055 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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COL9A2Q14055 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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COL9A2Q14055 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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COL9A2Q14055 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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COL9A2Q14055 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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