Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKP1Q13835 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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PKP1Q13835 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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PKP1Q13835 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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PKP1Q13835 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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PKP1Q13835 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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