Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
ALCAMQ13740 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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