Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms