Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRGP23470 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRGP23470 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRGP23470 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRGP23470 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRGP23470 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRGP23470 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRGP23470 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRGP23470 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRGP23470 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRGP23470 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRGP23470 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRGP23470 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRGP23470 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRGP23470 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRGP23470 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRGP23470 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRGP23470 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRGP23470 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRGP23470 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRGP23470 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRGP23470 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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