Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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