Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ERVV-1B6SEH8 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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