Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms