Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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