Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 GCNT3-201ENST00000396065 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AOAH-210ENST00000617267 2398 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC113615.1-201ENST00000507424 4121 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 CEBPG-202ENST00000585933 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 HEATR4-202ENST00000553558 3523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 KIAA1217-202ENST00000376451 7383 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AL359396.1-201ENST00000623151 2376 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 MAVS-201ENST00000416600 11596 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 KCNMA1-203ENST00000354353 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 LRIG2-201ENST00000361127 11555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 NUTM2B-AS1-212ENST00000610681 4241 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 INTS7-202ENST00000366993 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC060780.1-202ENST00000590740 5084 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 GRIN2A-205ENST00000535259 4118 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.5 ms