Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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