Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
ZNF239Q16600 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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