Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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SGCGQ13326 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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SGCGQ13326 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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SGCGQ13326 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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SGCGQ13326 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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SGCGQ13326 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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SGCGQ13326 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
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SGCGQ13326 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
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SGCGQ13326 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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SGCGQ13326 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCGQ13326 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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