Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms