Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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PTPRAP18433 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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