Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SHOC2Q9UQ13 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms