Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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HMGN3Q15651 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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HMGN3Q15651 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
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