Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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SMCO1Q147U7 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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SMCO1Q147U7 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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SMCO1Q147U7 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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