Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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SNTA1Q13424 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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SNTA1Q13424 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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SNTA1Q13424 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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