Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RIGQ13278 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RIGQ13278 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RIGQ13278 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RIGQ13278 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RIGQ13278 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RIGQ13278 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RIGQ13278 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RIGQ13278 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RIGQ13278 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RIGQ13278 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RIGQ13278 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RIGQ13278 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RIGQ13278 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RIGQ13278 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RIGQ13278 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RIGQ13278 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RIGQ13278 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RIGQ13278 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RIGQ13278 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RIGQ13278 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RIGQ13278 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RIGQ13278 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RIGQ13278 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151 ms