Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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ERCC8Q13216 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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ERCC8Q13216 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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ERCC8Q13216 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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ERCC8Q13216 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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ERCC8Q13216 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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ERCC8Q13216 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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ERCC8Q13216 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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ERCC8Q13216 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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ERCC8Q13216 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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