Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
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PTPRDP23468 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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PTPRDP23468 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
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PTPRDP23468 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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PTPRDP23468 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
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PTPRDP23468 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
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PTPRDP23468 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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