Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LINC00587B1AMM8 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms