Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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