Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF7Q6Q0C0 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms