Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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