Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
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