Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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FOXE3Q13461 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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FOXE3Q13461 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
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FOXE3Q13461 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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FOXE3Q13461 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
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FOXE3Q13461 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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FOXE3Q13461 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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