Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
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