Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms