Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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PTP4A2Q12974 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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PTP4A2Q12974 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTP4A2Q12974 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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