Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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