Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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