Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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