Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms