Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms