Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms