Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms