Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms