Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms