Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms